鉴于啤酒废水具有良好的生物可降解性，处理方法主要以生物法为主。由于废水中含有大量的悬浮物，进入生物处理单元之前需要进行预处理。目前。啤酒废水的生物处理技术只要有接触氧化法、SBR法、厌氧-好氧联合处理技术等。
1     接触氧化法
接触氧化法是20世纪80年代国内处理啤酒废水的主要工艺，由于进水的COD浓度高，一般采用两级接触氧化工艺。采用接触氧化法可以防止高糖含量废水引起污泥膨胀现象，并且不用投配N、P营养和污泥回流。
2     SBR法
SBR法运行方式灵活，可以根据水质水量的变化调整一个周期的的各个工段的运行时间。由于整个处理过程中缺氧、充氧交替发生，限制了丝状菌过度繁殖，同时采用限制曝气方式，增大反应过程中的传质梯度，故处理效果较为理想。
3     酸化-SBR工艺
这种方法早处理啤酒废水时，厌氧反应放弃反应时间长、控制条件要求高的甲烷发酵阶段，将反应控制在酸化阶段，故水解池体积小，不需要收集产生的沼气，简化了构造，降低了造价，便于维护，且产生的剩余污泥量少。同时，经水解反应后溶解性COD比例有所增加，有利于微生物对基质的摄取，为后续好氧生物处理创造更为有利的条件。酸化-SBR法处理高浓度啤酒废水效果比较理想，去除率可以达到95%以上，最高可达99%以上。酸化-SBR法处理中高浓度啤酒废水时，前置酸化工艺的运行至关主要，酸化效果的好坏直接影响SBR反应器的处理效果，而有机物的去除主要集中在SBR反应器中。酸化-SBR法处理啤酒废水受进水碱度和反应温度的影响，最佳温度是24℃，最佳碱度范围时500~750mg/L。
4     UASB-好氧接触氧化工艺
上流式厌氧污泥床能耗低、运行稳定、出水水质好，有效地降低了好样生化单元的处理负荷和运行能耗。好氧接触氧化对废水中的SS和COD均有较高的去除率，这是因为废水经过厌氧处理后仍含有许多易生物降解的有机物。上流式厌氧污泥床和好氧接触氧化池相串联的啤酒废水处理工艺具有处理效率高、运行稳定、能耗低、容易调试和易于重新启动等特点。整个工艺对COD的去除率可达95%以上，对悬浮物的去除率高达97%以上。
5     内循环UASB反应器+氧化沟工艺
UASB反应器的出水水质一般都比较稳定，通过内循环回流能提高UASB反应器对进水水温、pH值和COD浓度的适应能力。后续的氧化沟可以得到优良的出水水质，因此这一组合工艺适合对处理出水水质要求高的场合。此外，内循环UASB反应器可根据啤酒生产的季节性、水质和水量的变化情况实时调整运行参数，能进一步降低运行费用。